Bio-informatique

Le développement de technologies expérimentales à haut débit a abouti à la génération de quantités importantes de données expérimentales. Ces données ne sont pas analysables en première intention. Elles nécessitent le déploiement et le recours à des outils informatiques dédiés permettant d’exploiter pleinement toutes ces données générées massivement :

• Construction et gestion de bases de données complexes, pipeline, ArrayExpress, GEO, Immgen, Biobase
• Structures moléculaires : Visualisation, analyse, classification, prédiction
• Analyse de séquences : Alignements, recherches de similarités, détection de motifs, MEME suite, ATAC-seq, RNA-seq, CHIP-seq, Microarrays
• Génomique : Annotation des génomes, génomique comparative, Gene Ontology, BamQC, Integrated Genome Browser, Galaxy, GREAT
• Phylogénie : Relations évolutives entre gènes, entre génomes, entre organismes
• Génomique fonctionnelle : Transcriptome, protéome, interactome
• Analyse des réseaux biomoléculaires : Réseaux métaboliques, d’interactions protéiques, de régulation génétique
• Biologie des systèmes : Modélisation et simulation des propriétés dynamiques des systèmes biologiques
• Analyse d’images ImageJ, Icy, MATLAB, Java, Tracking
• Statistiques appliquées à la biologie, Anova, limma, Vampire
• Programmation C, Python, Perl, R, Bash, Java, Javascript, HTML, CSS, PHP, MySQL

Les experts d’Inovarion sauront vous accompagner dans l’exploitation des données générées par ces approches haut débit.