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Bio-informatique

Le développement de technologies expérimentales à haut débit a abouti à la génération de quantités importantes de données expérimentales. Ces données ne sont pas analysables en première intention. Elles nécessitent le déploiement et le recours à des outils informatiques dédiés permettant d’exploiter pleinement toutes ces données générées massivement :

  • Construction et gestion de bases de données complexes, pipeline, ArrayExpress, GEO, Immgen, Biobase
  • Structures moléculaires : Visualisation, analyse, classification, prédiction
  • Analyse de séquences : Alignements, recherches de similarités, détection de motifs, MEME suite, ATAC-seq, RNA-seq, CHIP-seq, Microarrays
  • Génomique : Annotation des génomes, génomique comparative, Gene Ontology, BamQC, Integrated Genome Browser, Galaxy, GREAT
  • Phylogénie : Relations évolutives entre gènes, entre génomes, entre organismes
  • Génomique fonctionnelle : Transcriptome, protéome, interactome
  • Analyse des réseaux biomoléculaires : Réseaux métaboliques, d’interactions protéiques, de régulation génétique
  • Biologie des systèmes : Modélisation et simulation des propriétés dynamiques des systèmes biologiques
  • Analyse d’images ImageJ, Icy, MATLAB, Java, Tracking
  • Statistiques appliquées à la biologie, Anova, limma, Vampire
  • Programmation C, Python, Perl, R, Bash, Java, Javascript, HTML, CSS, PHP, MySQL

Les experts d’Inovarion sauront vous accompagner dans l’exploitation des données générées par ces approches haut débit.

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